MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori Puno120 plasmid pHPPN120

Total Repeats: 170

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017377	A	6	6	370	375	100 %	0 %	0 %	0 %	385229300
2	NC_017377	CGA	2	6	489	494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385229300
3	NC_017377	CAA	2	6	651	656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229300
4	NC_017377	A	6	6	655	660	100 %	0 %	0 %	0 %	385229300
5	NC_017377	AATAC	2	10	696	705	60 %	20 %	0 %	20 %	385229300
6	NC_017377	A	9	9	709	717	100 %	0 %	0 %	0 %	385229300
7	NC_017377	ACA	2	6	883	888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229300
8	NC_017377	AT	3	6	911	916	50 %	50 %	0 %	0 %	385229300
9	NC_017377	TG	3	6	919	924	0 %	50 %	50 %	0 %	385229300
10	NC_017377	A	6	6	1040	1045	100 %	0 %	0 %	0 %	385229300
11	NC_017377	ACGCA	2	10	1117	1126	40 %	0 %	20 %	40 %	385229300
12	NC_017377	GAAC	2	8	1152	1159	50 %	0 %	25 %	25 %	385229300
13	NC_017377	AAAAC	2	10	1163	1172	80 %	0 %	0 %	20 %	385229300
14	NC_017377	AAG	2	6	1247	1252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229300
15	NC_017377	AGA	2	6	1284	1289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229300
16	NC_017377	A	7	7	1305	1311	100 %	0 %	0 %	0 %	385229300
17	NC_017377	CAA	2	6	1312	1317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229300
18	NC_017377	CCAA	2	8	1334	1341	50 %	0 %	0 %	50 %	385229300
19	NC_017377	CAAAG	2	10	1455	1464	60 %	0 %	20 %	20 %	385229300
20	NC_017377	A	7	7	1468	1474	100 %	0 %	0 %	0 %	385229300
21	NC_017377	GAA	2	6	1480	1485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229300
22	NC_017377	CAAG	2	8	1494	1501	50 %	0 %	25 %	25 %	385229300
23	NC_017377	CAA	2	6	1518	1523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229300
24	NC_017377	GAA	2	6	1542	1547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229300
25	NC_017377	CA	3	6	1551	1556	50 %	0 %	0 %	50 %	385229300
26	NC_017377	AGA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229300
27	NC_017377	AGC	2	6	1797	1802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385229301
28	NC_017377	TCCA	2	8	2197	2204	25 %	25 %	0 %	50 %	385229302
29	NC_017377	GTTGT	2	10	2205	2214	0 %	60 %	40 %	0 %	385229302
30	NC_017377	AAG	2	6	2279	2284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229302
31	NC_017377	CTTG	2	8	2381	2388	0 %	50 %	25 %	25 %	385229302
32	NC_017377	GTT	2	6	2392	2397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229302
33	NC_017377	TTTGA	2	10	2457	2466	20 %	60 %	20 %	0 %	385229302
34	NC_017377	TTG	2	6	2481	2486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229302
35	NC_017377	CT	4	8	2573	2580	0 %	50 %	0 %	50 %	385229302
36	NC_017377	CT	4	8	2582	2589	0 %	50 %	0 %	50 %	385229302
37	NC_017377	GT	3	6	2612	2617	0 %	50 %	50 %	0 %	385229302
38	NC_017377	CT	3	6	2644	2649	0 %	50 %	0 %	50 %	385229302
39	NC_017377	CTG	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385229302
40	NC_017377	TTGC	2	8	2780	2787	0 %	50 %	25 %	25 %	385229302
41	NC_017377	CTTT	2	8	2794	2801	0 %	75 %	0 %	25 %	385229302
42	NC_017377	CTT	2	6	2822	2827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229302
43	NC_017377	T	6	6	2870	2875	0 %	100 %	0 %	0 %	385229302
44	NC_017377	GTT	2	6	4189	4194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229303
45	NC_017377	GATTT	2	10	4244	4253	20 %	60 %	20 %	0 %	385229303
46	NC_017377	TTA	2	6	4293	4298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229303
47	NC_017377	T	6	6	4313	4318	0 %	100 %	0 %	0 %	385229303
48	NC_017377	TTG	2	6	4324	4329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229303
49	NC_017377	AG	3	6	4353	4358	50 %	0 %	50 %	0 %	385229303
50	NC_017377	T	7	7	4386	4392	0 %	100 %	0 %	0 %	385229303
51	NC_017377	TGTTT	2	10	4480	4489	0 %	80 %	20 %	0 %	385229303
52	NC_017377	A	6	6	4685	4690	100 %	0 %	0 %	0 %	385229304
53	NC_017377	AAAGT	2	10	4756	4765	60 %	20 %	20 %	0 %	385229304
54	NC_017377	AAGA	2	8	4818	4825	75 %	0 %	25 %	0 %	385229304
55	NC_017377	AT	3	6	4844	4849	50 %	50 %	0 %	0 %	385229304
56	NC_017377	ATG	2	6	4855	4860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229304
57	NC_017377	A	7	7	4865	4871	100 %	0 %	0 %	0 %	385229304
58	NC_017377	TTA	2	6	4875	4880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229304
59	NC_017377	A	6	6	4987	4992	100 %	0 %	0 %	0 %	385229305
60	NC_017377	A	6	6	5011	5016	100 %	0 %	0 %	0 %	385229305
61	NC_017377	A	6	6	5031	5036	100 %	0 %	0 %	0 %	385229305
62	NC_017377	AC	3	6	5126	5131	50 %	0 %	0 %	50 %	385229305
63	NC_017377	AG	3	6	5141	5146	50 %	0 %	50 %	0 %	385229305
64	NC_017377	GTT	2	6	5230	5235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385229305
65	NC_017377	CAA	2	6	5560	5565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229306
66	NC_017377	A	6	6	5683	5688	100 %	0 %	0 %	0 %	385229306
67	NC_017377	ATCA	2	8	6308	6315	50 %	25 %	0 %	25 %	385229307
68	NC_017377	A	6	6	6391	6396	100 %	0 %	0 %	0 %	385229307
69	NC_017377	GAA	2	6	6397	6402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229307
70	NC_017377	CAC	2	6	6431	6436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229307
71	NC_017377	ACC	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229307
72	NC_017377	TAA	2	6	6528	6533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229307
73	NC_017377	ATT	2	6	6684	6689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229307
74	NC_017377	A	6	6	6699	6704	100 %	0 %	0 %	0 %	385229307
75	NC_017377	ACA	2	6	6713	6718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229307
76	NC_017377	ATT	2	6	6739	6744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229307
77	NC_017377	AG	3	6	6745	6750	50 %	0 %	50 %	0 %	385229307
78	NC_017377	CAA	2	6	6888	6893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229307
79	NC_017377	CTT	2	6	6914	6919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229307
80	NC_017377	AAGA	2	8	7144	7151	75 %	0 %	25 %	0 %	385229307
81	NC_017377	AAACAA	2	12	7228	7239	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385229307
82	NC_017377	TTGAA	2	10	7343	7352	40 %	40 %	20 %	0 %	385229307
83	NC_017377	ACA	2	6	7409	7414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229307
84	NC_017377	AAC	2	6	7468	7473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229307
85	NC_017377	CAA	2	6	7494	7499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229307
86	NC_017377	ACT	2	6	7515	7520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229307
87	NC_017377	A	7	7	7542	7548	100 %	0 %	0 %	0 %	385229307
88	NC_017377	AGA	2	6	7560	7565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229307
89	NC_017377	C	6	6	7573	7578	0 %	0 %	0 %	100 %	385229307
90	NC_017377	TGA	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229307
91	NC_017377	AT	3	6	7623	7628	50 %	50 %	0 %	0 %	385229307
92	NC_017377	AAC	2	6	7684	7689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229307
93	NC_017377	TGA	2	6	7910	7915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229308
94	NC_017377	CAC	2	6	7947	7952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229308
95	NC_017377	AG	4	8	8102	8109	50 %	0 %	50 %	0 %	385229308
96	NC_017377	CCTG	2	8	8168	8175	0 %	25 %	25 %	50 %	385229308
97	NC_017377	A	6	6	8220	8225	100 %	0 %	0 %	0 %	385229308
98	NC_017377	AAT	2	6	8240	8245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229308
99	NC_017377	GAA	2	6	8313	8318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385229308
100	NC_017377	A	6	6	8317	8322	100 %	0 %	0 %	0 %	385229308
101	NC_017377	A	6	6	8324	8329	100 %	0 %	0 %	0 %	385229308
102	NC_017377	CATG	2	8	8474	8481	25 %	25 %	25 %	25 %	385229308
103	NC_017377	CAT	2	6	8516	8521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229308
104	NC_017377	A	8	8	8533	8540	100 %	0 %	0 %	0 %	385229308
105	NC_017377	TGC	2	6	8564	8569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385229308
106	NC_017377	GAAA	2	8	8576	8583	75 %	0 %	25 %	0 %	385229308
107	NC_017377	A	6	6	8607	8612	100 %	0 %	0 %	0 %	385229308
108	NC_017377	GAAA	2	8	8708	8715	75 %	0 %	25 %	0 %	385229309
109	NC_017377	ACC	2	6	8739	8744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229309
110	NC_017377	CAAAT	2	10	8750	8759	60 %	20 %	0 %	20 %	385229309
111	NC_017377	GAAG	2	8	8783	8790	50 %	0 %	50 %	0 %	385229309
112	NC_017377	A	7	7	8847	8853	100 %	0 %	0 %	0 %	385229309
113	NC_017377	TGA	2	6	8869	8874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229309
114	NC_017377	ATCA	2	8	8888	8895	50 %	25 %	0 %	25 %	385229309
115	NC_017377	CTTG	2	8	8914	8921	0 %	50 %	25 %	25 %	385229309
116	NC_017377	TGA	2	6	8992	8997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385229309
117	NC_017377	TGG	2	6	9004	9009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385229309
118	NC_017377	A	6	6	9014	9019	100 %	0 %	0 %	0 %	385229309
119	NC_017377	CAA	2	6	9048	9053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229309
120	NC_017377	CAT	2	6	9130	9135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229309
121	NC_017377	A	6	6	9156	9161	100 %	0 %	0 %	0 %	385229309
122	NC_017377	TCA	2	6	9243	9248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229309
123	NC_017377	TAC	2	6	9272	9277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229309
124	NC_017377	AAC	2	6	9296	9301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385229309
125	NC_017377	TTTCT	2	10	9367	9376	0 %	80 %	0 %	20 %	385229309
126	NC_017377	GT	3	6	9444	9449	0 %	50 %	50 %	0 %	385229310
127	NC_017377	CAC	2	6	9458	9463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229310
128	NC_017377	CAAT	2	8	9503	9510	50 %	25 %	0 %	25 %	385229310
129	NC_017377	CTT	2	6	9573	9578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385229310
130	NC_017377	TAT	2	6	9579	9584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385229310
131	NC_017377	CT	3	6	9746	9751	0 %	50 %	0 %	50 %	385229310
132	NC_017377	TTAG	2	8	9773	9780	25 %	50 %	25 %	0 %	385229310
133	NC_017377	CAT	2	6	9886	9891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385229310
134	NC_017377	A	7	7	9892	9898	100 %	0 %	0 %	0 %	385229310
135	NC_017377	CCA	2	6	9937	9942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385229310
136	NC_017377	TTTC	2	8	9970	9977	0 %	75 %	0 %	25 %	385229310
137	NC_017377	GT	3	6	10049	10054	0 %	50 %	50 %	0 %	385229310
138	NC_017377	GATT	2	8	10202	10209	25 %	50 %	25 %	0 %	385229310
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140	NC_017377	ATA	2	6	10342	10347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385229310
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.